Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNAP12004 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNAP12004 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNAP12004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNAP12004 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNAP12004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNAP12004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNAP12004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNAP12004 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNAP12004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNAP12004 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNAP12004 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNAP12004 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNAP12004 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNAP12004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNAP12004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNAP12004 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNAP12004 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNAP12004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNAP12004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNAP12004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNAP12004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNAP12004 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNAP12004 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNAP12004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNAP12004 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNAP12004 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNAP12004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNAP12004 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNAP12004 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNAP12004 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNAP12004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNAP12004 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNAP12004 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNAP12004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNAP12004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNAP12004 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms