Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RARBP10826 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RARBP10826 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RARBP10826 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RARBP10826 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RARBP10826 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RARBP10826 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARBP10826 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARBP10826 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARBP10826 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RARBP10826 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RARBP10826 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARBP10826 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARBP10826 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARBP10826 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARBP10826 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARBP10826 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RARBP10826 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARBP10826 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARBP10826 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RARBP10826 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARBP10826 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARBP10826 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARBP10826 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARBP10826 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARBP10826 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARBP10826 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARBP10826 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARBP10826 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARBP10826 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARBP10826 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARBP10826 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARBP10826 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARBP10826 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms