Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CHGAP10645 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHGAP10645 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHGAP10645 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHGAP10645 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHGAP10645 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHGAP10645 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHGAP10645 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHGAP10645 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGAP10645 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGAP10645 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGAP10645 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHGAP10645 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHGAP10645 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CHGAP10645 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHGAP10645 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHGAP10645 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHGAP10645 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHGAP10645 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CHGAP10645 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGAP10645 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGAP10645 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGAP10645 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGAP10645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGAP10645 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHGAP10645 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHGAP10645 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CHGAP10645 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHGAP10645 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHGAP10645 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CHGAP10645 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHGAP10645 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CHGAP10645 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CHGAP10645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHGAP10645 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHGAP10645 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHGAP10645 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHGAP10645 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHGAP10645 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHGAP10645 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHGAP10645 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHGAP10645 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHGAP10645 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHGAP10645 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHGAP10645 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHGAP10645 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHGAP10645 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHGAP10645 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHGAP10645 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHGAP10645 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms