Protein–RNA interactions for Protein: P0C0S5

H2AFZ, Histone H2A.Z, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFZP0C0S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFZP0C0S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFZP0C0S5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFZP0C0S5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFZP0C0S5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFZP0C0S5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFZP0C0S5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFZP0C0S5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFZP0C0S5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms