Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PKHD1P08F94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PKHD1P08F94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKHD1P08F94 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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