Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS17P08708 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS17P08708 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS17P08708 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS17P08708 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS17P08708 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS17P08708 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS17P08708 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS17P08708 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS17P08708 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS17P08708 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS17P08708 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS17P08708 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS17P08708 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS17P08708 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS17P08708 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS17P08708 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS17P08708 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS17P08708 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS17P08708 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS17P08708 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS17P08708 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS17P08708 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS17P08708 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS17P08708 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS17P08708 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS17P08708 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS17P08708 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS17P08708 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS17P08708 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS17P08708 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS17P08708 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS17P08708 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS17P08708 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS17P08708 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS17P08708 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS17P08708 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS17P08708 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS17P08708 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS17P08708 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS17P08708 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms