Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP3P08254 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP3P08254 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP3P08254 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP3P08254 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP3P08254 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP3P08254 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP3P08254 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP3P08254 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP3P08254 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP3P08254 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP3P08254 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP3P08254 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP3P08254 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP3P08254 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP3P08254 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP3P08254 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP3P08254 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP3P08254 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP3P08254 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP3P08254 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP3P08254 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP3P08254 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP3P08254 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP3P08254 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP3P08254 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP3P08254 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP3P08254 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP3P08254 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP3P08254 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP3P08254 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP3P08254 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP3P08254 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP3P08254 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP3P08254 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms