Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB3P05106 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB3P05106 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3P05106 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms