Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRUB2O95900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRUB2O95900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRUB2O95900 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRUB2O95900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms