Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX6O95503 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX6O95503 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX6O95503 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX6O95503 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX6O95503 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX6O95503 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX6O95503 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX6O95503 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX6O95503 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX6O95503 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX6O95503 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX6O95503 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX6O95503 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX6O95503 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX6O95503 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX6O95503 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX6O95503 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX6O95503 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX6O95503 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX6O95503 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX6O95503 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX6O95503 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX6O95503 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX6O95503 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX6O95503 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX6O95503 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX6O95503 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX6O95503 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX6O95503 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX6O95503 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX6O95503 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX6O95503 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX6O95503 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX6O95503 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX6O95503 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX6O95503 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX6O95503 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CBX6O95503 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX6O95503 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX6O95503 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX6O95503 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX6O95503 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX6O95503 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX6O95503 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX6O95503 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms