Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAPBO95292 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAPBO95292 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAPBO95292 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAPBO95292 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAPBO95292 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAPBO95292 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAPBO95292 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAPBO95292 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAPBO95292 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAPBO95292 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAPBO95292 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAPBO95292 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAPBO95292 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAPBO95292 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAPBO95292 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAPBO95292 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAPBO95292 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAPBO95292 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAPBO95292 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAPBO95292 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAPBO95292 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAPBO95292 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms