Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPIPB7O75200 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPIPB7O75200 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms