Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDF1O60869 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDF1O60869 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDF1O60869 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDF1O60869 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDF1O60869 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDF1O60869 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDF1O60869 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDF1O60869 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDF1O60869 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDF1O60869 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDF1O60869 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDF1O60869 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDF1O60869 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDF1O60869 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDF1O60869 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDF1O60869 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDF1O60869 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDF1O60869 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDF1O60869 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDF1O60869 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDF1O60869 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDF1O60869 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDF1O60869 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDF1O60869 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDF1O60869 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDF1O60869 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDF1O60869 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDF1O60869 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDF1O60869 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDF1O60869 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDF1O60869 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDF1O60869 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDF1O60869 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDF1O60869 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDF1O60869 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDF1O60869 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDF1O60869 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDF1O60869 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms