Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM3APO60318 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM3APO60318 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3APO60318 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM3APO60318 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms