Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA5O60264 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA5O60264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA5O60264 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms