Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RASGRF2O14827 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRF2O14827 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms