Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CAPN9O14815 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms