Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DFFAO00273 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DFFAO00273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DFFAO00273 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DFFAO00273 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DFFAO00273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DFFAO00273 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DFFAO00273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DFFAO00273 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DFFAO00273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DFFAO00273 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DFFAO00273 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DFFAO00273 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DFFAO00273 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DFFAO00273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DFFAO00273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DFFAO00273 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DFFAO00273 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DFFAO00273 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DFFAO00273 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DFFAO00273 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DFFAO00273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DFFAO00273 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DFFAO00273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DFFAO00273 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DFFAO00273 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DFFAO00273 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DFFAO00273 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DFFAO00273 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DFFAO00273 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DFFAO00273 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DFFAO00273 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms