Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UMAD1C9J7I0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UMAD1C9J7I0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UMAD1C9J7I0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208 ms