Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01549A6NIU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC01549A6NIU2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms