Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6CA6NDK9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA6CA6NDK9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6CA6NDK9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms