Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL33A6NCF5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL33A6NCF5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL33A6NCF5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms