Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP69A5D8W1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP69A5D8W1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP69A5D8W1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms