Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A4D1N5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4D1N5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A4D1N5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4D1N5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4D1N5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4D1N5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4D1N5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4D1N5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4D1N5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4D1N5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4D1N5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4D1N5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4D1N5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4D1N5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4D1N5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4D1N5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4D1N5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A4D1N5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A4D1N5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A4D1N5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms