Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMX2A2RU54 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMX2A2RU54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX2A2RU54 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms