Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PRG0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1W2PRG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1W2PRG0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1W2PRG0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms