Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GVL5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GVL5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A1B0GVL5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GVL5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms