Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYA0

TMED7-TICAM2, Protein TMED7-TICAM2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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