Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN7Q9Y6W3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN7Q9Y6W3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms