Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRPRBQ9Y5M8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRPRBQ9Y5M8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms