Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCAF1Q9Y4C2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCAF1Q9Y4C2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms