Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RAD54L2Q9Y4B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RAD54L2Q9Y4B4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
RAD54L2Q9Y4B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RAD54L2Q9Y4B4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAD54L2Q9Y4B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290 ms