Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FCF1Q9Y324 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FCF1Q9Y324 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FCF1Q9Y324 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms