Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NUDCQ9Y266 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NUDCQ9Y266 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NUDCQ9Y266 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUDCQ9Y266 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms