Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNEQ9Y223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GNEQ9Y223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNEQ9Y223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNEQ9Y223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms