Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRPC6Q9Y210 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPC6Q9Y210 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms