Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMK2AQ9UQM7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAMK2AQ9UQM7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms