Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM33Q9UPN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM33Q9UPN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms