Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDV3Q9UKY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDV3Q9UKY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDV3Q9UKY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms