Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERG28Q9UKR5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERG28Q9UKR5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERG28Q9UKR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms