Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PARP4Q9UKK3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PARP4Q9UKK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PARP4Q9UKK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PARP4Q9UKK3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms