Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF2Q9UK05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GDF2Q9UK05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDF2Q9UK05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDF2Q9UK05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDF2Q9UK05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GDF2Q9UK05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms