Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX25Q9UHL0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX25Q9UHL0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX25Q9UHL0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms