Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5BQ9UGL1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5BQ9UGL1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5BQ9UGL1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5BQ9UGL1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms