Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCOR3Q9P2K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR3Q9P2K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR3Q9P2K3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms