Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABI3Q9P2A4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 646.3 ms