Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C19orf12Q9NSK7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C19orf12Q9NSK7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C19orf12Q9NSK7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms