Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTPS2Q9NRF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTPS2Q9NRF8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTPS2Q9NRF8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.8 ms