Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR8Q9NR97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR8Q9NR97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLR8Q9NR97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms