Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCNB1IP1Q9NPC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNB1IP1Q9NPC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms